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大多數(shù)胃腸病具體發(fā)病機制尚不完全清楚。與多種危險因素相關(guān),包括病原微生物感染、化學(xué)刺激、飲食因素、藥物作用、應(yīng)激、吸煙、精神狀態(tài)、遺傳因素等。胃腸病是上述多種危險因素相互作用，最終造成的胃腸道保護(hù)功能降低導(dǎo)致的。
●病原微生物感染:某些病原微生物如幽門螺桿菌的慢性持續(xù)性感染，可引起胃部病變,出現(xiàn)相應(yīng)的癥狀表現(xiàn)。
●化學(xué)刺激:如濃茶、咖啡、烈酒、調(diào)味品等刺激性物質(zhì)，可引起急性或慢性胃炎。
●飲食因素:如進(jìn)食過冷、過燙或粗糙食物等損傷胃黏膜誘發(fā)胃部疾病;研究表明，飲食沒有規(guī)律、食肉過多、纖維類食物食用過少等是促使大腸癌發(fā)的危險因素之一。
●藥物作用:如長期大量服用非甾體類藥物(如阿司匹林,吲哚美辛等)可破壞黏膜屏障而引起胃部疾病。
●應(yīng)激:手術(shù)、燒傷、休克、創(chuàng)傷、多器官衰竭等引起的應(yīng)激狀態(tài)。
●吸煙:煙草中的尼古丁既影響胃黏膜的血液循環(huán)，又可導(dǎo)致幽門括約肌功能紊亂，造成膽汁反流，而各種膽汁反流均可破壞黏膜屏障,從而導(dǎo)致慢性胃炎的發(fā)生。
●精神狀態(tài):如長期壓力過大、精神抑郁、情緒緊張、憂愁焦慮等。
●遺傳因素:某些胃腸病如家族性腸息肉病、多發(fā)性家族性腸腺瘤病等的易感性，具有家族遺傳性。